引入不可pip安装的git子模块后导入包报ModuleNotFoundError如何解决

操作正确性确认 #

你的git初始化、添加子模块、给sys.path追加子模块路径的操作都完全正确，没有操作失误。

报错根因 #

你引入的keras-deep-graph-learning仓库最后更新时间较早，适配的是旧版本Keras（2.3及更早版本）。在Keras 2.4+以及被整合进TensorFlow的tf.keras版本中，keras.engine.topology模块已经被废弃，原有的Layer类迁移到了keras.engine.base_layer路径下，因此触发了模块找不到的报错。

可用解决方法 #

方案1：修改仓库源码（优先推荐，不影响现有环境） #

• 打开报错指向的文件：keras-deep-graph-learning/keras_dgl/layers/graph_cnn_layer.py
• 将第4行的导入语句：

from keras.engine.topology import Layer

替换为以下任意一种写法即可：

# 写法1：适配新版原生Keras
from keras.engine.base_layer import Layer
# 写法2：适配tf.keras
from tensorflow.keras.layers import Layer

• 检查同目录下其他层文件（如multi_graph_cnn_layer.py、graph_attention_cnn_layer.py等），只要存在from keras.engine.topology import Layer的语句都做相同修改，即可解决该报错。

方案2：降级Keras版本 #

如果不想修改源码，可将环境的Keras版本降级到2.3.1，同时配套安装TensorFlow 2.0.x版本即可兼容该仓库的原有代码。该方案的缺点是可能会影响你其他依赖高版本TensorFlow/Keras的项目运行。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者yihao ren