ggplot2中geom_rect与facet_grid搭配使用时点数据异常重复问题

你遇到的问题本质是ggplot2的图层数据继承与分面分组逻辑冲突导致的：

• 你调用geom_rect时没有为该图层单独指定数据集，也没有在映射中关联分面用到的category.1、category.2两个分组变量
• 当ggplot2执行分面逻辑时，会默认把没有明确分组关联的图层识别为「全局通用图层」，为了让这类图层能在所有分面正常显示，会自动对当前已有的数据集（也就是你给geom_point用的syn.dat）做全量分组展开，导致每个分面都被塞入了全部的点数据，而非对应分组的点数据。

有两种常用的修复方法，都可以保证每个分面只显示对应分组的点，同时所有分面都保留背景阴影：

方案1：给geom_rect单独指定空数据集，关闭继承 #

明确告诉geom_rect不需要继承其他图层的数据集，也不需要匹配分面分组：

ggplot() +
  geom_rect(
    data = data.frame(), 
    aes(xmin = -Inf, xmax = Inf, ymin = .5, ymax = Inf),
    fill = "lightyellow",
    inherit.aes = FALSE
  ) +
  geom_point(data = syn.dat, aes(x = x, y = y)) +
  facet_grid(cols = vars(category.1), rows = vars(category.2))

方案2：用annotate绘制全局注释 #

annotate是ggplot2专门用来绘制全局非数据关联注释的函数，本身不会参与分面的分组计算，更适合这类全分面统一背景的场景：

ggplot(syn.dat, aes(x = x, y = y)) +
  annotate("rect", xmin = -Inf, xmax = Inf, ymin = .5, ymax = Inf, fill = "lightyellow") +
  geom_point() +
  facet_grid(cols = vars(category.1), rows = vars(category.2))

内容的提问来源于stack exchange，提问作者InColorado