R语言ggtree绘制热图时自定义x轴取值范围的方法咨询

gheatmap() 调用时会自动重设x轴范围适配热图和树的总宽度，会覆盖你此前设置的x轴参数，你只需要在热图的配置代码最后，重新指定x轴的范围与标签规则即可实现需求：

h1 <- gheatmap(p1, landuse, 
               offset = 15, width = 0.05, font.size = 3, colnames_position = "top", colnames_angle = 0,
               colnames_offset_y = 0, hjust = 0) +
  scale_fill_manual(breaks = c("Forest", "Jungle rubber", "Rubber", "Oil palm"),
                    values = c("#458B00", "#76EE00", "#1874CD", "#00BFFF"), name = "Land use system",
                    na.value = "white") +
  # 新增以下x轴配置：revts翻转后实际坐标范围为-80~0，用abs转换标签显示为0~80
  scale_x_continuous(limits = c(-80, 0), labels = abs)

注意事项 #

• 若设置后出现树或热图边缘被截断的情况，可给limits留少量余量，比如改为c(-82, 2)，也可补充expand参数控制边缘留白：

  scale_x_continuous(limits = c(-80, 0), labels = abs, expand = c(0.01, 0))
  

• 不要使用xlim()设置范围，该函数会直接覆盖已有的scale_x_continuous配置，导致你之前设置的绝对值标签失效。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Anh