如何从多层子文件夹复制DICOM图像到公共文件夹并按规则重命名

修改要点 #

• 调整DICOM文件匹配规则为全递归匹配，无需固定目录层级，适配任意嵌套的文件夹结构
• 新增父目录名提取逻辑：直接取每个dcm文件所在的上一级目录（即你提到的患者专属唯一命名文件夹）作为文件名前缀
• 替换原脚本的os.rename为shutil.copy2，实现文件复制而非移动，保留源文件不变同时保留文件元数据
• 新增目标目录自动创建逻辑，避免目标路径不存在时报错
• 重命名规则直接拼接「患者文件夹名_原文件名」，完全匹配你需要的命名格式

完整可运行代码 #

import glob
import os
import shutil

# 源路径与目标路径定义
dir_src = r"/path/to/folder_with_subfolders/"
dir_dst = r"/path/to/destination/"    

# 自动创建目标文件夹（如果不存在）
os.makedirs(dir_dst, exist_ok=True)

# 递归获取所有后缀为.dcm的文件
files = glob.glob(os.path.join(dir_src, '**/*.dcm'), recursive=True)     

for file in files:
    # 1. 获取原文件名，示例值：1.dcm
    base_filename = os.path.basename(file)
    # 2. 获取该dcm文件所在的父目录名，示例值：Subfolder_with_patientID1
    patient_folder = os.path.basename(os.path.dirname(file))
    # 3. 拼接成新文件名，示例值：Subfolder_with_patientID1_1.dcm
    new_filename = f"{patient_folder}_{base_filename}"
    # 4. 生成目标文件完整路径
    dst_path = os.path.join(dir_dst, new_filename)
    # 5. 避免覆盖已存在的文件
    if not os.path.exists(dst_path):
        # 复制文件，若需要移动源文件可替换为 os.rename(file, dst_path)
        shutil.copy2(file, dst_path)

可选优化 #

如果存在同一患者文件夹下有同名dcm的极端情况，可以在新文件名后添加时间戳/随机数后缀进一步避免重名。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者shiva