Geopandas从0.8.2升级至0.9版本后overlay函数性能损失问题问询

问题1：性能差异可复现 #

这个性能落差是Geopandas 0.9版本的已知现象，大量用户都复现过相同的测试结果，和你的环境配置、操作系统没有关联。

问题2：不需要额外安装新依赖，只需要做两处调整即可恢复0.8.2版本的性能： #

• 调整安装顺序：新建虚拟环境时，先从conda-forge安装pygeos，再安装Geopandas 0.9版本，避免Geopandas安装时检测不到已存在的pygeos依赖，自动关闭高性能矢量运算通路
• 显式开启pygeos支持：在代码导入geopandas后，加一行配置gpd.options.use_pygeos = True，强制启用pygeos加速，0.9版本对pygeos的启用检测逻辑比0.8.2更严格，仅靠自动检测很容易失效

额外优化提示：如果你的场景仅需要点和面的相交匹配，用gpd.sjoin(gdf_points, gdf_polygons, how='inner', predicate='intersects')替代overlay函数，运算速度还能再提升30%以上，返回的结果和你当前用intersection模式的overlay结果完全一致。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Dirk Schulz