Ubuntu20.04运行unitas已安装LWP::Simple等Perl模块仍提示缺失

根本原因 #

你当前使用的是miniconda3自带的Perl环境（可执行文件路径为/home/stewart/miniconda3/bin/perl），而你使用sudo cpan安装模块时，模块会被安装到root用户对应的Perl库路径下，该路径不在当前普通用户miniconda3 Perl的@INC搜索列表里，因此运行程序时无法识别到已安装的模块。
服务器硬重启后问题触发，大概率是重启后conda环境被自动激活，默认Perl从系统版本切换为了conda内的版本，此前安装在系统Perl中的模块自然无法被识别。

解决方法 #

方法1：使用当前用户的cpan安装模块 #

不要加sudo，直接运行以下命令，模块会被安装到miniconda3对应的Perl库目录中，符合@INC搜索规则：

cpan install LWP::Simple Archive::Extract

方法2：通过conda安装预编译模块（更适配conda环境，推荐） #

直接从bioconda源安装对应Perl模块，避免编译等问题：

conda install -c bioconda perl-lwp-simple perl-archive-extract

验证安装 #

安装完成后执行以下命令，无报错且输出ok即为安装成功：

perl -MLWP::Simple -e 'print "ok\n"'
perl -MArchive::Extract -e 'print "ok\n"'

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Stewart Russell