Ubuntu18.04下使用conda升级R 4.0.5到4.1.1版本异常原因咨询
R 4.1.1升级失败原因说明
- 未指定精确的安装版本
直接执行conda install -c conda-forge r-base时,conda不会默认拉取上游最新版本,而是优先选择适配当前环境所有已有依赖的最高版本。如果你的环境中已经安装了大量依赖R 4.0.5的第三方包,conda会自动放弃升级R版本,避免出现依赖冲突。 - 频道优先级配置冲突
如果你本地conda的全局配置中,defaults、bioconda等其他频道的优先级高于conda-forge,即使本次命令临时指定了从conda-forge拉取,conda仍可能从优先级更高的频道拉取版本更低的r-base包。 - 旧版conda的解析逻辑缺陷
你使用的conda 4.9.2属于较早的版本,默认依赖解析器的逻辑存在局限性,对较新的包依赖链识别能力不足,经常出现无法匹配到最新可用版本的问题。 - 系统版本兼容限制
你使用的Ubuntu 18.04内置系统依赖库版本较低,conda-forge渠道的R 4.1.1编译时依赖更高版本的系统组件(如glibc),conda会自动过滤不符合当前系统兼容条件的版本,导致无法拉取到4.1.1安装包。 - 本地频道缓存未更新
若你长时间未更新本地conda的频道索引缓存,conda无法感知到conda-forge上已经上架的R 4.1.1版本,仍会按照旧索引记录的最高版本(即4.0.5)完成安装。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者ZheFrench
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