R语言使用tableone包输出含卡方统计量的分层表方法咨询
tableone基线表同时输出卡方统计量与p值的设置方法
你可以通过调整print()函数的参数实现需求,具体操作如下:
操作步骤
方案1:新版tableone包直接设置参数(推荐)
0.13.0及以上版本的tableone包已经内置了相关输出参数,你只需要在原打印代码中新增showTestStatistic = TRUE即可,修改后代码如下:
print(Table_int, nonnormal = biomarkers, exact = "stage", quote = TRUE, noSpaces = TRUE, showAllLevels = TRUE, showTestStatistic = TRUE) # 新增该行参数
修改后输出的表格会在p列前新增检验统计量列,分类变量会直接显示卡方检验的χ²值,和p值同时展示。
方案2:旧版本tableone兼容方案
如果你使用的是更早无showTestStatistic参数的版本,可以手动提取检验结果合并到输出表:
- 先提取分类变量检验结果:
cat_test_res <- Table_int$CatTable - 每个变量对应的卡方值可通过
attr(cat_test_res[[1]], "pValues")的statistic列获取,手动整合到打印后的表格中即可。
注意事项
- 如果你的分类变量指定了Fisher精确检验而非常用的卡方检验,输出的统计量会对应替换为Fisher检验的精确统计值
- 连续变量如果使用t检验/方差分析/Kruskal-Wallis检验,开启该参数后也会同步输出对应的t值/F值/H值
内容的提问来源于stack exchange,提问作者n23
相关产品推荐
相关产品推荐

