使用pandas读取CSV列作为检索参数请求网站报No connection adapters错误

云上老周

2026-10-5

问题原因

你通过pd.read_csv读取数据后得到的Chem是DataFrame类型对象，而非你预期的分子式字符串。直接将DataFrame与URL字符串拼接时，pandas会输出包含列名、行号的完整表格文本，生成非法URL格式，requests无法识别该格式才抛出对应错误。

修复后的代码

import requests
import pandas as pd
from bs4 import BeautifulSoup as BS
import time

# 读取CSV文件
df = pd.read_csv('single.csv', usecols=['Molecular Formula'])

# 遍历每个分子式单独发起请求
for formula in df['Molecular Formula']:
    # 用params参数自动处理URL编码，避免手动拼接出错
    query_params = {
        'utf8': '✓',
        'query': formula,
        'searcher': 'metabolites',
        'button': ''
    }
    res = requests.get('https://hmdb.ca/unearth/q', params=query_params)
    # 增加请求状态校验，避免异常终止
    if res.status_code != 200:
        print(f"分子式{formula}查询失败，状态码：{res.status_code}")
        time.sleep(1)
        continue
    soup = BS(res.content, 'html.parser')
    hit_list = soup.find_all('div', attrs={'class':'hit-name'})
    print(f"\n=== {formula} 检索结果 ===")
    for div in hit_list:
        print(div.text.strip())
    # 增加请求间隔，避免被网站拦截
    time.sleep(1)