如何解决XGBoost运行时无法从xgboost.compat导入scipy_csr的ImportError问题

核心原因 #

该报错是XGBoost版本与Scipy版本不兼容导致：Scipy 1.7.0及以上版本移除了旧版稀疏矩阵接口，而1.6.0以下版本的XGBoost未适配Scipy的新接口，调用时就会触发该导入错误。

排查步骤 #

• 确认当前环境的XGBoost版本，执行命令：pip show xgboost，查看返回结果的Version字段
• 确认当前环境的Scipy版本，执行命令：pip show scipy，查看返回结果的Version字段
• 验证Python环境一致性：你当前报错路径对应Python 3.9版本，执行pip命令时需确认使用的是对应3.9版本的pip，避免依赖安装到其他Python环境的冲突问题

解决方法 #

• 方案1（优先推荐）：升级XGBoost到适配版本，执行命令：

  pip install xgboost>=1.6.0 -U
  

  1.6.0及以上版本的XGBoost已经完成Scipy新接口适配，兼容性最好。
• 方案2：如果项目要求不能升级XGBoost，可降级Scipy到兼容版本，执行命令：

  pip install scipy<=1.6.1 -U
  

• 如果上述操作后仍报错，先完全卸载旧版本依赖再重新安装：

  pip uninstall -y xgboost scipy
  pip install xgboost>=1.6.0 scipy
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Dewi P Lee