macOS 11.5.2安装Cytoscape v3.8.2系统检查失败问题咨询

你遇到的问题由两个独立的兼容性问题共同导致：

• Cytoscape v3.8.2 的 macOS 系统检查脚本存在版本判断逻辑bug：该脚本开发时 macOS 仍使用10.x的版本号命名规则，比较逻辑未适配11+的大版本号，因此误将11.5.2判定为低于10.11的不受支持版本。
• 当前安装的Java 12不属于Cytoscape v3.8.2的兼容版本范围，也会触发启动失败。

方案一：适配修复v3.8.2版本 #

1. 修复Java版本兼容问题
   卸载当前系统中的Java 12，安装Cytoscape v3.8.2官方支持的Java 11长期支持版本即可，不要使用Java 9、10、12等非长期支持版本，也不要安装Java 13及以上的高版本。
2. 绕过错误的系统版本检查

• 若还未完成安装，打开下载的dmg安装包，右键点击Cytoscape安装程序选择「显示包内容」，进入Contents/Resources/路径找到system_check.sh文件。
• 若已经完成安装，进入/Applications/Cytoscape_v3.8.2/Cytoscape.app/Contents/Resources/路径找到system_check.sh文件。
• 用文本编辑器打开该脚本，注释掉所有和macOS版本判断相关的代码段，或者将版本判断的最低阈值改为11.0，保存修改后重新运行安装程序/启动Cytoscape即可。
• 此前放置在CytoscapeConfiguration目录下的disable-opencl.dummy文件无需修改，保留即可。

方案二：更换高版本Cytoscape（更简便） #

直接下载安装Cytoscape v3.9.0及以上的版本，这类版本已经修复了macOS 11+的版本判断bug，且自带适配的Java运行环境，无需单独安装Java，也不需要手动修改脚本。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user16838383