使用指定conda环境的shebang运行Python脚本时input()触发EOFError

报错成因 #

conda 4.9及以上版本中，conda run命令默认会捕获子进程的标准输入(stdin)、标准输出(stdout)、标准错误(stderr)，不会将终端的输入流透传给执行的Python进程。当代码运行到input()尝试读取输入时，输入流为空，就会抛出EOFError。
而先激活conda环境再运行Python脚本时，Python进程直接在当前交互shell中启动，可以正常读取终端的输入流，所以不会报错。

解决方案 #

方案1：直接使用目标环境Python解释器的绝对路径作为shebang（最稳定） #

这是兼容性最好、无额外开销的方案，操作步骤：

1. 执行以下命令查询TEST环境的Python解释器绝对路径：

conda run -n TEST which python

2. 将查询到的路径直接写在shebang行即可，示例（替换为你自己查询到的路径）：

#!/Users/你的用户名/miniconda3/envs/TEST/bin/python

def main(): # testing
    chromatogram_result = input()
    print(chromatogram_result)

if __name__ == "__main__":
    main()

后续直接运行./my_file.py就可以正常读取输入，不需要提前激活环境。

方案2：给conda run添加透传输入输出的参数 #

如果不想写死绝对路径，可以给conda run添加--no-capture-output参数（conda 4.10+支持），修改shebang为：

#!/usr/bin/env conda run -n TEST --no-capture-output python

注意：部分老旧Unix系统的shebang机制不支持传递多个参数，可能会失效，你当前使用的macOS 10.14环境支持该写法。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user16837577