已安装Pillow仍报错？R中Keras图像加载问题求助

之前我的Keras/TensorFlow原本可以正常运行，后来莫名崩溃，于是按以下步骤卸载重装：

• 安装ANACONDA 2019.03 X64版本；
• 在Anaconda Prompt执行以下命令：

  conda update -n base -c defaults conda
  pip install --upgrade pillow
  conda install -c conda-forge keras tensorflow
  pip install tensorflow --upgrade
  

• 安装R 3.6.0；
• 安装Rstudio 1.2.1335；
• 安装Rtools3.5并勾选"add rtools to syst path"；
• 在Rstudio中执行以下代码：

  install.packages("devtools")
  library(devtools)
  devtools::install_github("rstudio/keras")
  library(keras)
  devtools::install_github("rstudio/tensorflow")
  library(tensorflow)
  install_tensorflow()
  

但运行Keras模型时出现错误：

Error in image_load(idx, target_size = c(64, 64)) : The Pillow Python package is required to load images

明明已经安装了Pillow，为什么还会报错？该如何解决？

环境详情 #

执行tf_config()结果：

TensorFlow v1.14.0 (C:\Users\Mezeix\ANACON~1\envs\R-TENS~1\lib\site-packages\tensorflow\__init__.p)

执行reticulate::py_config()结果：

python: C:\Users\Mezeix\Anaconda3\envs\r-tensorflow\python.exe
libpython: C:/Users/Mezeix/Anaconda3/envs/r-tensorflow/python36.dll
pythonhome: C:\Users\Mezeix\ANACON~1\envs\R-TENS~1
version: 3.6.8 |Anaconda, Inc.| (default, Feb 21 2019, 18:30:04) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)]
Architecture: 64bit
numpy: C:\Users\Mezeix\ANACON~1\envs\R-TENS~1\lib\site-packages\numpy
numpy_version: 1.16.4
tensorflow: C:\Users\Mezeix\ANACON~1\envs\R-TENS~1\lib\site-packages\tensorflow\__init__.p
python versions found:
C:\Users\Mezeix\Anaconda3\envs\r-tensorflow\python.exe
C:\Users\Mezeix\ANACON~1\python.exe
C:\Users\Mezeix\Anaconda3\python.exe

问题分析与解决办法 #

从你的环境信息能看出来，核心问题是R的reticulate包没有关联到正确的Python环境——你在Anaconda的base环境装了Pillow，但R实际调用的是r-tensorflow这个虚拟conda环境，而这个环境里根本没装Pillow，所以才会报错。

具体解决步骤： #

1. 激活R对应的conda环境并安装Pillow
   打开Anaconda Prompt，先切换到r-tensorflow环境：

   conda activate r-tensorflow
   

   然后直接在这个环境里安装Pillow，推荐用conda安装更适配环境：

   conda install -c anaconda pillow
   # 也可以用pip：pip install pillow
   

2. 在R里验证Pillow是否可用
   打开RStudio，执行以下代码确认Pillow能被正确导入：

   library(reticulate)
   # 也可以直接用这个命令在指定环境安装Pillow，省得切换终端
   # py_install("pillow", envname = "r-tensorflow")
   pillow <- import("PIL")
   print(pillow$`__version__`)
   

   如果能正常打印出Pillow的版本号，说明关联成功了。

3. 重启RStudio并测试模型
   环境变量的更新有时候需要重启才能生效，关闭RStudio再重新打开，然后运行你的Keras模型，应该就不会再出现Pillow缺失的报错了。

额外小贴士： #

以后安装Python相关包时，尽量确保是在R当前使用的conda环境里操作。可以在R里执行reticulate::use_condaenv("r-tensorflow", required = TRUE)强制指定环境，后续用py_install安装的包都会直接到这个环境里，避免再出现环境不一致的问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Laurent