Ubuntu系统下无法从命令行运行R的问题排查与解决

一、查看通过应用程序打开的R的运行路径 #

有几种简单的方法可以找到这个路径：

• 方法1：用进程命令查找
  先通过应用程序打开R，然后打开终端运行：

  ps aux | grep R
  

  在输出结果里找带有/bin/R或者/lib/R/bin/R的行，那就是应用程序启动的R的完整路径。
• 方法2：查看桌面快捷方式配置
  R的桌面快捷方式通常是.desktop文件，你可以在以下目录里找：
  • 系统级：/usr/share/applications/
  • 用户级：~/.local/share/applications/
    找到名为R.desktop的文件，用文本编辑器打开，查看Exec=后面的内容，就是启动R的命令和路径。
• 方法3：在R内部查看
  打开应用程序里的R，在控制台输入：

  Sys.getenv("R_HOME")
  

  输出的就是R的安装根目录，对应的可执行文件一般在${R_HOME}/bin/R。

二、解决Anaconda环境下R的共享库错误 #

你遇到的libreadline.so.6找不到的问题，是因为Anaconda的R依赖的readline库缺失或者路径不对，试试下面几个方案：

方案1：安装Anaconda的readline包

先激活你的Anaconda环境（如果用的是base环境可以跳过激活）：

conda activate your_env_name

然后安装readline：

conda install readline

安装完成后再尝试运行R，看是否解决问题。

方案2：临时/永久设置库路径

如果系统里已经有libreadline.so.6（或者更高版本兼容），可以把系统的库路径加到环境变量里：

• 临时生效：终端里运行

  export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/x86_64-linux-gnu:$LD_LIBRARY_PATH
  

  （注意：如果是32位系统，路径是/usr/lib，根据自己的系统调整）
  然后再输入R试试。
• 永久生效：把上面的命令添加到你的shell配置文件里，比如~/.bashrc（bash用户）或者~/.zshrc（zsh用户），添加后运行source ~/.bashrc使配置生效。

方案3：创建软链接兼容版本

如果系统里只有更高版本的readline（比如libreadline.so.7），可以给Anaconda的R创建一个软链接：

ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libreadline.so.7 /home/aknirala/anaconda3/lib/R/lib/libreadline.so.6

注意替换成你系统里实际的libreadline路径和Anaconda的R库路径。

方案4：重新安装/更新Anaconda的R

如果上面的方法都不行，试试更新或重装Anaconda的R：

# 更新R
conda update r-base

# 或者重装
conda remove r-base
conda install r-base

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user1953366