Rails集成R应用Docker化：Ruby镜像安装R报错如何解决

1. 基于Ruby镜像安装R失败的原因 #

你用的ruby:2.7.1官方镜像底层是**Debian 10（Buster）**发行版，但你手动添加的是Ubuntu 18.04（Bionic）的CRAN软件源，跨发行版的软件源会导致依赖版本完全不匹配，触发依赖冲突自然无法安装r-base相关包。另外你执行apt-get install r-base没有加-y参数，也会因为需要人工确认安装步骤而失败。

2. 基于R镜像安装Ruby失败的原因 #

你犯了两个环境变量的顺序错误：

• 你先把rbenv克隆到了~/.rbenv路径，执行克隆操作时你还没有定义HOME环境变量，默认root用户的HOME是/root，rbenv实际被安装到了/root/.rbenv路径下
• 后续你把HOME改成了/home/shalev，配置的PATH指向的是/home/shalev/.rbenv路径，和实际安装路径不一致，自然找不到rbenv命令。另外Docker的RUN指令默认使用非交互式shell，不会加载.bashrc配置，你写进.bashrc的环境变量在构建阶段根本不会生效。

方案一（基于Ruby镜像安装R的修复版Dockerfile） #

FROM ruby:2.7.1 AS rails-toolbox
RUN apt-get update -qq && apt-get install -y --no-install-recommends \
    build-essential \
    libpq-dev \
    nodejs \
    apt-utils \
    apt-transport-https \
    wget \
    gnupg2 \
    ca-certificates

# 添加Debian 10对应的CRAN源
RUN wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/debian/marutter_pubkey.asc | gpg --dearmor > /usr/share/keyrings/cran-archive-keyring.gpg
RUN echo "deb [signed-by=/usr/share/keyrings/cran-archive-keyring.gpg] https://cloud.r-project.org/bin/linux/debian buster-cran40/" >> /etc/apt/sources.list.d/cran.list

RUN apt-get update && apt-get install -y r-base

RUN mkdir /app
WORKDIR /app 
ADD shalev/Gemfile /app/Gemfile
ADD shalev/Gemfile.lock /app/Gemfile.lock
RUN bundle install  --without development test doc --jobs=4

COPY shalev/ /app/

方案二（基于R镜像安装Ruby的修复版Dockerfile） #

FROM rocker/r-ver:3.6.3

# 先定义HOME变量，保证后续操作都基于这个路径
ENV HOME /home/shalev
ENV RUBY_VERSION 2.7.1
# 提前把rbenv路径加入PATH
ENV PATH "$HOME/.rbenv/bin:$HOME/.rbenv/shims:$PATH"

RUN apt-get update -qq && apt-get install -y --no-install-recommends \
    apt-utils \
    apt-transport-https \
    build-essential \
    libpq-dev \
    nodejs \
    git-core \
    zlib1g-dev \
    libssl-dev \
    libreadline-dev \
    libyaml-dev \
    libsqlite3-dev \
    sqlite3 \
    libxml2-dev \
    libxslt1-dev \
    libcurl4-openssl-dev \
    software-properties-common \
    libffi-dev \
    yarn \
    curl \
    bzip2

# 克隆rbenv到指定HOME路径
RUN git clone https://github.com/rbenv/rbenv.git $HOME/.rbenv
RUN mkdir -p "$(rbenv root)"/plugins \
    && git clone https://github.com/rbenv/ruby-build.git "$(rbenv root)"/plugins/ruby-build

RUN rbenv install $RUBY_VERSION
RUN rbenv global $RUBY_VERSION

RUN mkdir /app

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Spätzle