R调用read.table时报'file' must be a character string or connection错误如何解决

错误原因 #

read.table函数的第一个入参要求为本地文件路径字符串/文件连接对象，你此处的使用逻辑错误：

• 执行newFile <- read.table("Nameofdataset.txt")后，newFile已经是加载到R运行环境中的数据框对象，不是文件路径
• 无论你直接传newFile变量、还是给变量名加引号传字符串"newFile"，都不符合入参要求：前者传入的是数据框类型不符合要求，后者会让read.table尝试在工作目录中查找名为newFile的文件，自然找不到对应资源报错。

解决方法 #

根据你的实际需求选择对应方案：

方案1：重新读取原始文件调整读取参数 #

直接传入原始文件路径即可，无需经过newFile中转：

newDat <- read.table("Nameofdataset.txt", header=TRUE, sep=",", stringsAsFactors=FALSE, strip.white=TRUE)

方案2：基于已读取的newFile对象调整数据结构 #

不需要重复调用read.table，直接对已有数据框做处理即可，以下是对应你原参数需求的处理示例：

# 提取第一行作为表头
colnames(newFile) <- as.character(newFile[1,])
# 移除表头行
newDat <- newFile[-1,]
# 去除所有字符列的前后空格、关闭因子转换
newDat <- as.data.frame(
  lapply(newDat, function(col) if(is.character(col)) trimws(col) else col),
  stringsAsFactors = FALSE
)

内容的提问来源于stack exchange，提问作者ayesha