Python Bokeh调用varea_stack绘制垂直堆叠面积图无显示问题排查

• 首先确认日期列doc的数据格式：Bokeh的datetime类型坐标轴要求x轴对应的数据为pandas datetime格式，如果你的doc列为字符串/object类型，需要先做格式转换：

  import pandas as pd
  cot_pvt['doc'] = pd.to_datetime(cot_pvt['doc'])
  

• 清理数据空值：varea_stack对NaN值兼容性极差，只要任意一个堆叠列存在空值，就可能出现渲染失败的情况，提前将所有空值填充为0：

  cot_pvt = cot_pvt.fillna(0)
  

• 确认堆叠列数据类型：所有clade对应的列必须为数值型（int/float），如果为object类型也会导致渲染失败，可手动转换格式：

  stackers = cot_pvt.columns.tolist()
  stackers.remove('doc')
  cot_pvt[stackers] = cot_pvt[stackers].astype(float)
  

• 如果你要实现归一化堆叠效果，需要先对每行数据做归一化处理，避免数值维度问题导致显示异常：

  # 按行计算每日总检出量
  row_sums = cot_pvt[stackers].sum(axis=1)
  # 每个clade的数值除以当日总检出量得到占比
  cot_pvt[stackers] = cot_pvt[stackers].div(row_sums, axis=0)
  # 归一化后可手动指定y轴范围，避免自动计算轴范围出错
  from bokeh.models import Range1d
  p.y_range = Range1d(0, 1)
  

• 检查配色配置：确认inferno配色已正确导入，非法颜色值也可能导致渲染异常：

  from matplotlib.cm import inferno
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Jonathan Barnell