R运行GLMER时如何忽略指定因子水平？鹿RSF土地覆盖分析场景

你需要剔除的水体对应Landcover_Type的取值4，只需要在设置参考组、拟合模型前，先过滤该类别观测并清理冗余因子水平即可，修改后的代码如下：

# 过滤掉所有水体类（Landcover_Type=4）的观测
pre_RSFpoints <- subset(pre_RSFpoints, Landcover_Type != 4)
# 删除已经不存在的因子水平，避免模型运行时报空水平错误
pre_RSFpoints$Landcover_Type <- droplevels(pre_RSFpoints$Landcover_Type)
# 按原有需求设置林地（取值2）为因子参考组
pre_RSFpoints<-within(pre_RSFpoints, Landcover_Type <-relevel(Landcover_Type, ref = 2))

# 后续模型拟合代码无需调整
pre_model <- glmer(Used ~ Landcover_Type + (1|Id),family="binomial",data=pre_RSFpoints)
summary(pre_model)

小提示：运行完成后可以执行table(pre_RSFpoints$Landcover_Type)，确认4对应的水体水平已经完全被移除，不会参与模型计算。

你原问题中附的样本数据参考：

内容的提问来源于stack exchange，提问作者JLD475