为什么Numpy.fromfile无法读取文件中的全部数值？

你遇到的报错和少读1个数值的问题，核心是np.fromfile的文本读取逻辑缺陷：

• np.fromfile设计初衷是更高效读取二进制数组文件，当你用文本模式打开文件、指定sep参数读取纯文本数值时，对文件末尾的空白（空格、换行、制表符等）识别存在bug：如果文件末尾多了一个空白分隔符，函数会判定为还有一个待读取的数值，但是读取不到有效内容，就会跳过最后一个有效数值，同时抛出你看到的DeprecationWarning。
• 部分Windows平台下，文本模式r打开文件时的自动换行符转换，也可能引入不可见字符干扰分隔识别，触发该问题。

方案1（推荐）：改用np.loadtxt读取文本数值文件 #

np.loadtxt是专门针对纯文本格式数值数组设计的读取函数，会自动处理首尾空白、多空格分隔、换行符等异常情况，不会出现少读问题：

import numpy as np
a = np.loadtxt('commemi2d0.1.node', dtype=np.float64)

方案2：坚持用np.fromfile的调整方法 #

如果必须用np.fromfile，可以通过两种调整规避问题：

• 先读取文件内容清理首尾空白，再用np.fromstring解析：

with open('commemi2d0.1.node', 'r') as fid:
    content = fid.read().strip()
a = np.fromstring(content, dtype=np.float64, sep=" ")

• 改用二进制模式打开文件，避免换行符转换干扰：

with open('commemi2d0.1.node', 'rb') as fid:
    a = np.fromfile(fid, dtype=np.float64, sep=" ")

内容的提问来源于stack exchange，提问作者kaustav ghosal