mice多重插补后glmer与glm模型比较及随机效应检验报错求助
解决
pool.compare报错:Model 'fit1' not larger than 'fit0' 这个错误的核心原因是你用来比较的两个模型类型不一致——fm1是混合效应模型(glmer输出的lmerMod类),而fm2是普通广义线性模型(glm输出的glm类),pool.compare无法正确识别它们的嵌套关系,误以为fm1并没有包含fm2的所有参数。
解决步骤
要修复这个问题,你需要让两个模型保持同一类型,即使fm2没有随机效应,也用glmer来拟合:
重新拟合两个模型,确保都使用
glmer,并且指定匹配的family参数(根据你的Treatment变量类型选择,比如二分类用binomial,连续变量用gaussian):# 带随机效应的模型 fm1 <- with(dti.mice1, glmer(Treatment ~ (1|Hospital) + Age, family = binomial)) # 替换成你实际需要的family # 不带随机效应的模型(用glmer拟合,保持类型一致) fm2 <- with(dti.mice1, glmer(Treatment ~ Age, family = binomial))再次运行
pool.compare:pool.compare(fm1, fm2)
额外说明
- 当你用
glmer拟合没有随机效应的模型时,它本质上会退化成普通的广义线性模型,但输出的对象类型和fm1一致,这样pool.compare就能正确识别fm1是fm2的扩展模型(多了一个随机截距的方差参数),从而完成嵌套模型的比较。 - 如果拟合过程中出现收敛警告,可以尝试调整
glmer的控制参数,比如增加迭代次数:fm1 <- with(dti.mice1, glmer(Treatment ~ (1|Hospital) + Age, family = binomial, control = glmerControl(optCtrl = list(maxfun = 1e5))))
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Eveline Wiegers
相关产品推荐
相关产品推荐

