如何批量运行指定目录下的所有Jupyter Notebooks文件？

Jupyter官方自带的转换工具本身就支持运行Notebook并写入运行结果，不需要额外安装第三方包：

• 单个文件运行命令：
  jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace 目标文件.ipynb
  参数说明：
  • --execute：执行Notebook内所有代码单元格
  • --to notebook：指定输出格式为Notebook格式
  • --inplace：直接将运行结果写入原文件，不需要生成新文件；如果需要保留原文件，删除该参数即可，会自动生成带运行结果的新Notebook文件
• 同目录下所有Notebook批量运行命令：
  • Linux/macOS终端：
    for f in *.ipynb; do jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace "$f"; done
  • Windows PowerShell：
    Get-ChildItem *.ipynb | ForEach-Object { jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace $_.FullName }

papermill是专门用于批量运行、参数化运行Jupyter Notebook的工具，支持自动记录运行状态、报错信息，不会修改原文件：

• 首先安装工具：
  pip install papermill
• 单个文件运行命令：
  papermill 原文件.ipynb 带运行结果的输出文件.ipynb
• 同目录下所有Notebook批量运行命令（运行后的文件统一加run_前缀，和原文件区分）：
  • Linux/macOS终端：
    for f in *.ipynb; do papermill "$f" "run_$f"; done
  • Windows PowerShell：
    Get-ChildItem *.ipynb | ForEach-Object { papermill $_.FullName ("run_" + $_.Name) }

• 如果希望某个Notebook运行报错时不中断后续任务，可以在命令后加--allow-errors参数即可跳过报错继续执行
• 批量操作前建议先备份所有原Notebook文件，避免异常情况导致文件损坏

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Marte Valerio Falcone