awk筛选FASTA文件时如何保留符合长度要求的序列及对应ID行

你可以通过临时存储标识行的方式实现需求，修正后的命令如下：

awk '/^>/{head=$0;next} length($0)>50 && length($0)<=800 {print head;print $0}' sample.txt

命令逻辑说明 #

• 遇到以>开头的标识行时，将该行内容存入变量head，执行next直接跳转处理下一行，不做输出
• 处理序列行时判断长度是否满足区间要求，符合条件则先打印之前存储的对应标识行，再打印当前序列行

另外你之前写的原始命令多了一个多余的右括号，会触发语法错误，上述命令已经修复了该问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Caterina