ggplot2如何设置仅显示2个图例项而非自动生成的6个？

优先方案（按教授建议使用substr()） #

你的问题核心是fill映射了含6个水平的Plot变量，所以生成了6个图例条目，只需新增一个仅包含「常绿林/落叶林」两个水平的分类变量做fill映射即可，用substr()提取Plot字段里的类型标识生成这个新变量：

• 第一步：新增森林类型字段，根据你实际的Plot命名调整substr的起止位置，比如你的Plot命名为「E1、E2、E3、D1、D2、D3」，取第1位即可区分类型，代码如下：

# 提取Plot标签的指定位置字符生成森林类型列
dbh.full$ForestType <- substr(dbh.full$Plot, start = 1, stop = 1)
# 替换为可读的类型名称
dbh.full$ForestType <- factor(dbh.full$ForestType, levels = c("E", "D"), labels = c("常绿林", "落叶林"))

• 第二步：修改ggplot映射逻辑，x轴仍用Plot保留6个箱形图，fill映射为新的ForestType变量：

ggplot(data=dbh.full, aes(x=Plot, y=D_2017, fill=ForestType)) + 
  geom_boxplot() +
  labs(x='Plot ID', y='Tree DBH', fill='Forest Type') +
  scale_fill_manual(values = c("常绿林" = "gray45", "落叶林" = "gray69"))

调整后图例只会显示2个条目，对应两类森林的配色。

替代方案（Plot无统一命名规则时使用） #

如果你的Plot命名没有可提取的公共标识，可以直接通过样地顺序判断生成类型列：

# 前3个样地为常绿林，后3个为落叶林
dbh.full$ForestType <- ifelse(as.integer(dbh.full$Plot) %in% 1:3, "常绿林", "落叶林")

后续绘图代码和上述方案一致即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者KindlyFowl42