AWS EC2实例中RStudio Server可运行Shiny应用但Shiny Server加载失败

问题原因 #

RStudio Server运行应用时使用你登录的个人用户身份，而Shiny Server默认配置下以shiny系统用户运行应用，两者的运行环境、权限、R包搜索路径完全不同，这是此类问题的核心诱因。

排查与解决步骤 #

• R包路径不兼容问题
  你在RStudio中安装的R包默认存放在当前用户家目录下的私有R库（例如~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0/这类路径），shiny用户无权限读取该路径，也不会默认加载该路径下的R库。
  解决方法二选一即可：
  1. 修改shiny-server.conf中的run_as参数，将run_as shiny;改为run_as 你登录RStudio使用的用户名;，改完重启Shiny Server服务生效
  2. 用sudo权限将应用依赖的所有包安装到系统级公共R库，执行命令：sudo R -e "install.packages(c('依赖包1','依赖包2'), lib = .Library)"
• 应用文件权限问题
  存放在/srv/shiny-server/下的应用文件（包括app.R、ui.R、server.R以及关联的静态数据文件）需要确保运行应用的用户有对应读写权限。
  解决方法：如果用默认的shiny用户运行，执行命令sudo chmod -R 755 /srv/shiny-server/你的应用目录；如果修改了run_as为个人用户，执行命令sudo chown -R 你的用户名:你的用户组 /srv/shiny-server/你的应用目录
• 硬编码路径问题
  如果应用中写了硬编码的绝对路径，例如读取/home/你的用户名/data/xxx.csv这类个人家目录下的文件，shiny用户无权限访问对应路径会导致初始化失败。
  解决方法：将应用内所有路径改为相对路径，所有用到的资源文件统一放到应用目录下管理。
• 查看应用具体报错
  你当前提供的是Shiny Server全局日志，仅提示初始化失败，具体报错会单独存放在/var/log/shiny-server/目录下对应应用的日志文件中，查看对应日志可直接定位具体故障点。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Erin