R使用ggplot2导出PDF时geom_tile设置size=0仍出现边框如何解决？

• macOS默认的PDF渲染引擎（Quartz）及R原生PDF导出设备对0线宽的矢量路径处理逻辑和屏幕栅格渲染不同：RStudio预览窗口用的是栅格渲染逻辑，size=0时会直接跳过边框绘制；但矢量设备会保留你设置了color="black"的边框路径，多数PDF阅读器会把线宽为0的矢量路径渲染为设备支持的最小线宽（通常是1像素），就会出现你看到的额外黑色边框，而PNG是栅格格式，导出时沿用屏幕渲染逻辑，所以不会有问题。

• 方案1：联动控制边框颜色和线宽，不需要显示边框时将颜色设为透明NA
  你可以新增一个开关参数控制边框状态，修改对应geom_tile代码即可，逻辑适配所有导出场景：

# 定义边框开关参数
show_diag_border <- FALSE # TRUE为显示边框，FALSE为隐藏

# 绘图代码中geom_tile部分修改为
geom_tile(data = diagDf, aes(var1, var2, fill = val),
          color = ifelse(show_diag_border, "black", NA),
          size = ifelse(show_diag_border, 0.2, 0))

当show_diag_border为FALSE时，边框设为透明，无论什么导出设备都不会显示边框，完全符合你的开关控制需求。

• 方案2：导出PDF时改用Cairo PDF设备
  如果你不想修改绘图代码，可以用代码调用Cairo PDF引擎导出，该设备对0线宽的处理和屏幕渲染逻辑一致，会直接忽略size=0的边框：

# 导出代码示例
cairo_pdf("heatmap_output.pdf", width = 6, height = 6)
p <- ggplot(sDf, aes(X1,X2)) + 
  geom_tile(aes(fill = value)) +
  scale_fill_gradientn(colors = colPal) +
  new_scale_fill() +
  geom_tile(data = diagDf, aes(var1, var2, fill = val),  color = "black",
            size = 0) +
  scale_fill_gradientn(colors = colPal2) +
  theme(aspect.ratio = 1)
print(p)
dev.off()

• 方案3：使用RStudio点选导出时修改引擎设置
  如果习惯用RStudio界面导出PDF，可以在导出弹窗中勾选使用Cairo PDF引擎选项，就能避免默认Quartz引擎的0线宽渲染问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Electrino