AWS EC2下Python导入rpy2报_cdata: FFI.CData语法错误如何解决

本次报错和R_HOME配置无关，核心是版本兼容性不匹配：你使用的rpy2 3.4.5版本中用到了Python 3.6才正式引入的变量类型注解语法，而当前环境的Python版本为3.5.10，不支持该语法，因此导入模块时直接触发SyntaxError。
此外rpy2 3.4.5对R的版本要求为≥3.5，你当前使用的R 3.4.1也存在版本偏低的问题，后续即使解决Python语法问题也可能出现适配报错。

方案1：降级rpy2到兼容Python3.5的版本 #

Python3.5支持的最高rpy2版本为2.9.x系列，执行以下命令重装即可：

pip uninstall -y rpy2
pip install rpy2==2.9.6

安装完成后使用你查询到的正确R_HOME路径配置即可，不要使用/usr/bin/R（该路径是R的可执行文件路径，不是R_HOME目录）：

import os
os.environ['R_HOME'] = '/usr/lib64/R/'
import rpy2.robjects as ro

方案2：升级运行环境适配高版本rpy2 #

如果允许调整运行环境，建议将Python升级到3.6及以上版本，同时将R升级到3.5及以上版本，即可兼容当前安装的rpy2 3.4.5，无需降级处理。

额外依赖检查 #

如果是yum包管理的EC2实例，建议提前安装R开发包避免后续调用R函数时缺失动态库：

sudo yum install R-devel -y

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Visuser