Rmarkdown代码块工作目录与.Rmd文件所在目录不一致问题问询

常见配置遗漏和操作问题如下： #

• RStudio全局编织配置未调整
  默认RStudio执行Rmd代码块、编织文档时使用的是R全局默认工作目录，而非.Rmd文件所在目录。修改方法：打开RStudio顶部菜单栏 Tools → Global Options → 找到R Markdown设置项，将Evaluate chunks in directory的下拉选项改为Document，重启RStudio后生效。
• 单文档自定义配置覆盖了全局规则
  检查你的.Rmd文件开头的YAML头部，有没有写死自定义渲染路径的配置，或者文档首个setup代码块中有没有类似 knitr::opts_knit$set(root.dir = "C:/DefaultWD") 的固定路径配置，这类设置优先级高于全局配置，直接修改或删除对应写死的路径即可。如果需要动态适配文档路径，可以在setup块中添加如下代码：

knitr::opts_knit$set(root.dir = dirname(rstudioapi::getSourceEditorContext()$path))

• 操作逻辑混淆
  如果你是单独选中代码块点「运行」按钮执行代码，此时调用的是当前R会话的工作目录，不会触发编织时的文档目录规则，只有点击「Knit」按钮编织整个文档时，才会默认使用.Rmd文件所在目录作为工作目录。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者yaennu.s