R语言mltools包Matthews相关系数(mcc)函数运行报错问题问询

mltools包的mcc()函数仅支持三种互斥的入参模式，三种模式不能同时使用，你当前代码同时传入了三类参数，触发了参数校验报错：

• 模式1：仅传入actuals（真实标签）和preds（预测标签）
• 模式2：仅传入TP/FP/TN/FN四个混淆矩阵统计值
• 模式3：仅传入confusionM（现成的混淆矩阵对象）

额外注意：你训练模型时将因变量Y转为了因子类型，预测输出的pred_rf也是因子类型，而测试集的data.test$Y是数值类型，如果选用模式1需要先统一二者数据类型。

三个方案任选其一即可：

方案1：使用真实标签+预测标签计算 #

# 统一预测值和真实值的数据类型
pred_rf_num <- as.numeric(as.character(pred_rf))
metrics_rf <- data.frame(MCC_rf = mcc(actuals = data.test$Y,
                                      preds = pred_rf_num))

方案2：使用混淆矩阵四个统计值计算 #

metrics_rf <- data.frame(MCC_rf = mcc(TP = tab_rf[1,1],
                                      FP = tab_rf[1,2],
                                      TN = tab_rf[2,2],
                                      FN = tab_rf[2,1]))

方案3：直接传入现成混淆矩阵计算 #

metrics_rf <- data.frame(MCC_rf = mcc(confusionM = tab_rf))

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Hecar