如何执行变量中存储的R Markdown代码并渲染为HTML/PDF

可行解决方案 #

你之前的方案失败的核心原因是：R Markdown是混合了Markdown文本和R代码块的复合格式，不能直接当作纯R代码执行，也无法通过单个chunk参数实现全流程渲染。

方案1：直接使用rmarkdown::render的text参数（推荐）

新版rmarkdown包（≥2.0版本）的render函数原生支持直接传入R Markdown字符串，不需要写入本地磁盘，渲染效果和读取本地文件完全一致。示例代码如下：

# 你的动态生成的R Markdown字符串变量
rmkdown_code <- '---
title: "test"
author: "me"
date: "3 June 2019"
output: html_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)

for (i in 1 :  3) { 
  cat('\\n') 
  print(summary(iris[i*50 : 50, "Sepal.Length"] ))
}

'

rmarkdown::render(
text = rmkdown_code,
output_format = "html_document",
output_file = "render_result.html"
)

#### 方案2：兼容老版本rmarkdown的虚拟连接方案
如果你使用的rmarkdown版本较低没有`text`参数，可以用`textConnection`创建虚拟文本连接作为输入源，同样不需要写入本地磁盘：
```r
rmarkdown::render(
  input = textConnection(rmkdown_code),
  output_format = "html_document",
  output_file = "render_result.html"
)

以上两种方案都会完整执行R Markdown中的所有代码块，生成的输出文件和读取本地.Rmd文件渲染的效果完全一致，代码执行结果、图表都可以正常生成。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Dev Ops