使用Cronjob运行Papermill报错：papermill为目录无法找到可执行文件路径

你当前的报错是因为pip show papermill返回的路径是Python库的安装目录，并非可执行文件路径，你填入的路径指向了papermill库的文件夹，因此触发papermill is a directory的错误。

直接在终端执行以下命令即可得到你平时直接调用的papermill可执行文件的绝对路径：

which papermill

执行后会返回类似/usr/local/bin/papermill、/Users/你的用户名/opt/anaconda3/bin/papermill的结果，这个就是你需要的可执行文件路径。

方案1：直接填写可执行文件绝对路径（推荐，稳定性最高） #

把你原来crontab命令里的/path-to-papermill/papermill替换成上一步which papermill返回的完整路径即可，调整后示例如下（注意整行不要换行）：

0 * * * * /Users/你的用户名/opt/anaconda3/bin/papermill /Users/username/path-to-code/notebook.ipynb /Users/username/path-to-code/output_notebook.ipynb > /tmp/stdout.log 2> /tmp/stderr.log

方案2：在crontab中声明PATH变量 #

crontab默认的PATH环境变量和你终端登录时的PATH不一致，因此也可以通过提前声明PATH的方式避免写全路径：

1. 先在终端执行echo $PATH，复制输出的完整内容
2. 打开crontab编辑界面，在所有定时任务的最上方新增一行，把复制的PATH内容粘贴进去，示例：

PATH=/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/Users/你的用户名/opt/anaconda3/bin
0 * * * * papermill /Users/username/path-to-code/notebook.ipynb /Users/username/path-to-code/output_notebook.ipynb > /tmp/stdout.log 2> /tmp/stderr.log

备选方案：通过Python模块调用 #

如果上述方案都有问题，也可以直接调用Python解释器执行papermill模块，先执行which python获取你常用的Python解释器全路径，再按如下格式写crontab：

0 * * * * /Users/你的用户名/opt/anaconda3/bin/python -m papermill /Users/username/path-to-code/notebook.ipynb /Users/username/path-to-code/output_notebook.ipynb > /tmp/stdout.log 2> /tmp/stderr.log

内容的提问来源于stack exchange，提问作者megansorel