R执行knit导出PDF时报xcrun路径无效、X11加载失败怎么解决

问题解决方法 #

你遇到的报错分为两类，分别对应以下解决步骤：

1. 修复xcrun路径报错（macOS专属问题） #

该报错是Xcode命令行工具未安装或路径失效导致，操作如下：

• 打开macOS自带的「终端」应用
• 若从未安装过Xcode命令行工具，执行命令：xcode-select --install，在弹出的安装窗口中按指引完成安装即可
• 若已安装过仍出现该报错，执行命令重置工具路径：sudo xcode-select --reset，输入你的电脑开机密码后回车确认即可

2. 修复View函数执行报错 #

该报错是导致knit导出中断的直接原因：View()是R交互式环境专属函数，仅支持在手动操作的R控制台/脚本编辑器运行，knit导出属于后台非交互式运行，无法调用打开可视化窗口的函数。
操作如下：

• 打开你的aswimmer_EconPS1.Rmd文件，定位到第11-36行范围内的View(aid_workers)代码
• 方案一：直接删除该行代码，knit过程不需要预览数据
• 方案二：替换为非交互式的查看代码，比如打印前10行数据用head(aid_workers, 10)，查看数据结构用str(aid_workers)
• 方案三：如果需要保留View()代码供本地手动运行，不想让它在knit时执行，可以给该代码所在的代码块添加eval=FALSE参数，示例：

  ```{r eval=FALSE}
  # 该代码块仅在本地手动运行时生效，knit时不执行
  View(aid_workers)
  

完成上述两步操作后重新执行knit导出即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Allison