查找R中已安装lefse包的路径及迁移、获取安装包的方法咨询

本地已安装包迁移步骤 #

• 在已安装lefse的旧设备上启动R/RStudio，执行命令 .libPaths()，返回的第一个路径即为当前用户的第三方R包默认存储目录
• 打开该目录，找到名为lefse的完整文件夹，将其复制到移动存储设备
• 在新设备上同样启动R/RStudio，执行.libPaths()打开对应的第三方包存储目录，将复制的lefse文件夹粘贴到该目录下
• 注意：两台设备的R核心大版本需保持一致（如均为R4.2系列或R4.3系列），且操作系统类型相同的情况下迁移成功率最高，跨操作系统迁移可能出现依赖兼容问题

通用离线安装包生成与安装方法 #

如果直接迁移文件夹出现兼容问题，可通过打包的方式完成安装：

• 在旧设备上安装devtools包后，执行命令 devtools::build("上一步找到的lefse文件夹的完整路径")，运行完成后会在默认工作目录生成后缀为.tar.gz的源安装包，Windows设备可额外指定参数生成.zip格式的二进制安装包
• 将生成的安装包传输到新设备后，执行命令 install.packages("安装包本地存储路径", repos = NULL, type = "source") 即可完成安装

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Anh