如何将其他Git仓库中的文件添加到dotfiles裸仓库

你的猜测完全正确，Git 会自动识别包含 .git 子目录的文件夹为嵌套仓库，默认不会在父仓库中追踪嵌套仓库内的单个文件，避免出现仓库嵌套冲突。可通过以下三种方案解决：

方案1：强制添加（最简便，适合单次添加少量文件） #

直接在 add 命令后加 -f 参数强制提交目标文件即可，该操作不会修改 oh-my-zsh 本身的 Git 仓库配置，仅会将指定文件纳入你的 dotfiles 仓库追踪：

dotfiles add -f /home/$USER/.oh-my-zsh/custom/aliases.sh

方案2：配置例外规则（适合需要长期追踪 oh-my-zsh 下多个自定义文件的场景） #

编辑 dotfiles 裸仓的排除规则文件 ~/.dotfiles/info/exclude，添加如下规则：

# 先忽略整个 oh-my-zsh 目录
.oh-my-zsh/*
# 放行 custom 目录
!.oh-my-zsh/custom/
# 忽略 custom 下所有内容
.oh-my-zsh/custom/*
# 单独放行你需要追踪的文件
!.oh-my-zsh/custom/aliases.sh
# 有其他需要追踪的自定义文件可以继续加!开头的放行规则
# !.oh-my-zsh/custom/themes/xxx.zsh-theme

配置完成后无需加 -f 参数，直接执行普通 add 命令即可生效。

方案3：文件重定向（最干净，完全避开嵌套仓库冲突） #

将自定义别名配置迁移到 oh-my-zsh 目录外的位置，操作步骤如下：

1. 新建存放自定义配置的目录：mkdir -p ~/.config/zsh/
2. 把 aliases.sh 移动到该目录：mv ~/.oh-my-zsh/custom/aliases.sh ~/.config/zsh/
3. 编辑原位置的 aliases.sh，仅保留一行加载逻辑：echo "source ~/.config/zsh/aliases.sh" > ~/.oh-my-zsh/custom/aliases.sh
4. 直接追踪外层的配置文件即可：dotfiles add ~/.config/zsh/aliases.sh

该方案完全避开了 oh-my-zsh 的嵌套仓库范围，后续同步到新设备、更新 oh-my-zsh 都不会出现配置冲突。

注意：不要将整个 .oh-my-zsh 目录纳入 dotfiles 追踪，oh-my-zsh 自带独立的版本管理和更新机制，仅追踪你自行修改的自定义配置即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者mnj