如何使用awk依据另一文件的映射关系替换指定文件的IID字段值

可直接运行的命令 #

如果你的文件是普通空格分隔，使用以下命令即可：

awk 'NR==FNR{map[$2]=$1;next} FNR==1{print;next} {$2=map[$2];print}' 文件2.txt 文件1.txt > 替换后结果.txt

如果你的文件是制表符（Tab）分隔，想要保留原文件的分隔格式，使用以下版本：

awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} NR==FNR{map[$2]=$1;next} FNR==1{print;next} {$2=map[$2];print}' 文件2.txt 文件1.txt > 替换后结果.txt

逻辑说明 #

• 先读取映射文件（文件2）：NR==FNR 判断当前处理的是第一个输入文件即文件2，将每行第二个字段（旧IID）作为键、第一个字段（新id）作为值存入map数组，读完当前行直接跳过后续逻辑处理下一行
• 再处理待替换文件（文件1）：
  • 第一行是表头，直接打印不做修改
  • 其余行将第二列（IID字段）替换为map数组中对应的新id值，再打印整行
• 最终结果输出到替换后结果.txt中，不会修改原文件，可放心测试

内容的提问来源于stack exchange，提问作者HKJ3