R语言使用Mclust基于因子分析结果聚类的报错问题求助

• Mclust函数传参逻辑错误：Mclust第一个入参要求是包含所有聚类特征的完整数据对象（矩阵/数据框），你将各字段单独拆分作为前几个入参传入，导致第二个本该指定聚类数G的参数被传入了字段数据，无法转换为整数类型，触发第二个报错。
• 语法书写错误：原代码中Data&ClinicalT1的&是R的逻辑与运算符，取数据框列应当使用$或者方括号索引。
• 特殊列名解析错误：列名包含%等特殊字符时，用$取列需要将列名用反引号包裹，否则R解析失败会误判Data为原子向量，触发$运算符对原子向量无效的报错。
• 方括号索引错误：Data["ClinicalT0"]返回的是单列数据框（列表类型），如果要提取列向量需要用Data[["ClinicalT0"]]或者Data$ClinicalT0。

如果你的聚类特征为ClinicalT0、ClinicalT1、%Data三列，可按以下方式编写代码：

# 提取所有聚类特征组成特征数据框
feature_df <- Data[, c("ClinicalT0", "ClinicalT1", "%Data")]
# 调用Mclust执行聚类
Clustering <- Mclust(data = feature_df, G = 4, modelNames = c("VII"))

如果要使用因子分析得到的4个因子作为聚类特征，只需要将上述代码中c()内的列名替换为4个因子对应的列名即可。

• 执行str(feature_df)确认提取的特征为数据框格式，不存在嵌套列表类字段
• 执行sum(is.na(feature_df))确认特征中无缺失值，避免后续聚类流程报错

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Filippo