Git status显示本地未删除文件为已删除，切换分支后问题反复出现

• 大小写不敏感文件系统冲突：这是该类问题最常见的诱因。Windows、macOS默认使用大小写不敏感的文件系统（如默认配置的NTFS、APFS），如果你切换的其他分支中存在同名但大小写不同的文件（比如后缀为小写的xyz.png），切换分支时文件系统会把两个大小写不同的文件视为同一个，直接覆盖内容。等你切回master分支时，Git要匹配的是xyz.PNG（大写后缀），但磁盘上留存的是小写版本，就会判定原大写文件被删除。
• Git钩子自动操作：如果仓库配置了post-checkout钩子脚本，可能在切换分支完成后自动执行预设的清理逻辑，误删了该PNG文件。
• 第三方软件干扰：如果仓库目录处于同步盘（OneDrive、iCloud、国内网盘等）的同步范围，或是被杀毒软件、企业安全管控软件监控，可能在切换分支产生文件变动的瞬间，被这类软件误判为风险文件自动删除。
• Git配置不匹配：如果本地Git的core.ignorecase配置和实际文件系统特性不匹配，比如文件系统是大小写不敏感，但手动将core.ignorecase设为了false，也会引发文件识别异常。

1. 优先排查大小写冲突
   执行以下命令查看不同分支的同名文件大小写情况：

# 查看master分支下该文件的真实文件名
git ls-tree master --name-only | grep -i xyz.png
# 查看你切换过的其他分支下的同名文件真实文件名
git ls-tree 其他分支名 --name-only | grep -i xyz.png

如果确认存在大小写不同的两个文件，统一两个分支的文件名大小写即可解决，建议统一使用全小写避免跨平台冲突：

# 先在master分支执行改名
git mv xyz.PNG xyz.png
git commit -m "统一PNG文件大小写，避免跨平台冲突"
git push
# 切到其他分支执行同样的改名操作合并即可

2. 排查Git钩子
   查看仓库.git/hooks目录下是否存在非.sample后缀的post-checkout文件，打开检查是否包含删除文件的相关逻辑，不需要的钩子直接删除该文件即可。
3. 排查第三方软件干扰
   把仓库移动到非同步目录、临时关闭杀毒软件监控后再测试切换分支，如果问题不再出现，将仓库目录加入对应软件的白名单即可。
4. 修正Git配置
   Windows、macOS下执行以下命令，确保配置和文件系统特性匹配：

git config --local core.ignorecase true

内容的提问来源于stack exchange，提问作者jawsnnn