R包开发中devtools::test()正常但devtools::check()无法定位yml文件

问题背景 #

开发R包时使用testthat编写单元测试，需要读取后缀为.yml的外部配置文件。按照R包开发规范，该文件放置在inst目录下。调用system.file()（而非base::system.file()，便于pkgload:::shim_system.file()拦截调用）配合yaml包加载文件执行单元测试时，运行devtools::test()全部测试通过，但运行devtools::check()时持续抛出文件未找到的错误。

测试过程中发现特殊现象：将文件后缀从.yaml/.yml修改为.txt后，devtools::check()不再报错。 #

相关代码与报错 #

测试代码：

## 位于test_that()内部
cf <- system.file("config", "config1.yml", package = "mypackage", mustWork = TRUE)

devtools::check()运行报错：

Error in `system.file("config", "config1.yml", package = "mypackage", mustWork = TRUE)`: no file found
Backtrace:
    x
1. \-base::system.file(...) test-set_config.R:34:2

[ FAIL 1 | WARN 0 | SKIP 0 | PASS 15 ]

注：将config1.yml重命名为config1.txt后，devtools::check()运行无报错。

运行环境：

• devtools版本：CRAN发布的最新v2.4.2
• R版本：4.1.1

问题定位与解决方案 #

后续排查已确认问题根源：此前为了忽略CI相关的yaml文件，误在.Rbuildignore中添加了[.]yml、[.]yaml通配规则，导致打包检查时inst目录下的yml配置文件也被过滤排除，因此无法被读取。

将.Rbuildignore中的yml/yaml匹配规则修改为匹配具体路径的精准规则后，问题即可解决，无需修改配置文件后缀。 #

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Vivek Atal