我来帮你解决这个困扰你的Eclipse Tomcat配置问题，分两部分给你讲清楚：

一、如何在Eclipse中直接设置Tomcat实例的appBase（不用每次手动改server.xml） #

有两种方式，你可以根据需求选择：

1. 给现有Tomcat实例修改配置 #

• 先打开Eclipse的Servers视图（没显示的话，通过Window > Show View > Servers调出来）。
• 找到你的Tomcat服务器，双击打开配置页面。
• 往下滑到Server Locations区域：
  • 如果你用的是默认的Use workspace metadata（Eclipse把应用部署在工作空间的tmp目录里），得把Host的appBase改成正确的目录。
  • 切换到Configuration标签页，在左侧树结构里展开server.xml → Host，右边找到appBase属性，将其值修改为wtpwebapps，保存即可。
  • 改完后这个实例就会一直沿用这个设置，不会自动变回webapps（除非你删除并重新创建实例）。

2. 修改模板让新实例自动生效 #

要是你希望每次新建Tomcat服务器都自动用wtpwebapps作为appBase，可以修改Eclipse的服务器模板：

• 打开Window > Preferences，依次展开Server > Runtime Environments。
• 找到你正在使用的Tomcat版本（比如Apache Tomcat v8.5），点击Edit。
• 在弹出的窗口中点击Open Launch Configuration，切换到Arguments标签页。
• 在VM arguments里添加一个系统属性：-Dcatalina.base="${workspace_loc}/.metadata/.plugins/org.eclipse.wtp.server.core/tmp0"（tmp0是Eclipse默认的Tomcat临时目录，多实例场景下可能是tmp1、tmp2等，根据实际情况调整）。
• 或者更彻底的方式：找到Eclipse安装目录下的plugins/org.eclipse.jst.server.tomcat.core_xxxxxx文件夹，找到对应Tomcat版本的模板xml文件，把Host元素的appBase属性改成wtpwebapps。不过要注意Eclipse版本更新可能会覆盖这个文件，记得提前备份。

二、为什么每次新建Tomcat服务器，appBase默认都是webapps？ #

原因很直接：Eclipse新建Tomcat实例时，会直接复制你本地Tomcat安装目录里的server.xml作为基础配置。而Tomcat原生的默认配置中，appBase就是指向安装目录下的webapps文件夹——这是Tomcat本身的默认行为，它原本就从这个目录加载Web应用。

Eclipse的WTP插件虽然会把应用部署到工作空间的wtpwebapps目录（方便热部署和环境隔离），但它默认不会修改Tomcat的原生配置，除非你手动调整部署设置。这就导致Tomcat启动后依然按照原生配置去读取webapps目录，而不是Eclipse实际部署应用的wtpwebapps目录，所以才会出现请求定向到空目录的问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者jaknichan