我来帮你梳理几个针对性的解决方向，搞定这个proj_api.h not found的编译错误：

1. 先确认proj_api.h的真实位置 #

你指定了--with-proj-include=/home/programs/anaconda3/include/，但如果你的Anaconda安装的是PROJ 6.x及以上版本，proj_api.h会被放到include/proj子目录里，而非直接在include根目录下。

先通过命令定位文件的实际路径：

find /home/programs/anaconda3 -name proj_api.h

假设找到的路径是/home/programs/anaconda3/include/proj/proj_api.h，那修改configure.args里的路径参数再尝试安装：

install.packages('sf', type = "source", configure.args='--with-gdal-config=/home/programs/anaconda3/bin/gdal-config --with-geos-config=/home/programs/anaconda3/bin/geos-config --with-proj-include=/home/programs/anaconda3/include/proj/ --with-proj-lib=/home/programs/anaconda3/lib/')

2. 用conda直接安装sf（最省心的方案） #

既然你已经在用Anaconda管理依赖，直接通过conda安装R的sf包可以避开手动配置路径的麻烦——conda会自动处理所有依赖的版本匹配和路径配置：

# 先激活你的conda环境（如果有单独的环境）
conda activate your_env_name
# 从conda-forge通道安装r-sf
conda install -c conda-forge r-sf

安装完成后，直接在R里执行library(sf)就能调用包了。

3. 通过环境变量指定依赖路径 #

在安装sf前，先设置系统环境变量，让编译器自动找到PROJ、GDAL的头文件和库：

# 在终端执行（也可以加到~/.bashrc里永久生效）
export CPLUS_INCLUDE_PATH=/home/programs/anaconda3/include:/home/programs/anaconda3/include/proj
export LIBRARY_PATH=/home/programs/anaconda3/lib
export LD_LIBRARY_PATH=/home/programs/anaconda3/lib

然后启动R，直接执行简化的安装命令：

install.packages('sf', type = "source")

4. 检查PROJ与GDAL的版本兼容性 #

你的GDAL版本是2.4.1，它对PROJ的兼容版本通常是4.x或5.x。如果Anaconda里的PROJ是6.x及以上，可能会和旧版本的GDAL、sf存在接口不兼容的问题。先检查PROJ版本：

/home/programs/anaconda3/bin/proj --version

如果是6+版本，可以尝试安装适配PROJ 6的sf版本（比如sf 0.9.0及以上），或者降级PROJ到5.x版本后再安装sf。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Sezen