R脚本命令行传参出现Execution halted报错如何解决

1. 函数参数拼写错误：R内置commandArgs()函数的参数采用驼峰命名规范，合法参数名为trailingOnly（第二个单词首字母O大写），你使用的全小写trailingonly不属于该函数的可识别参数，因此触发「未使用参数」报错。
2. Shell变量未正确解析：终端命令中你使用单引号包裹--args后的参数列表，Unix/Linux 环境下的shell中单引号会关闭所有特殊字符解析，$fileA这类变量会以字面量形式传入R，无法替换为你提前定义的实际取值。

• 首先修正R脚本中的参数获取代码：

args <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)

• 其次修改终端执行命令，将包裹参数的单引号替换为双引号，触发shell变量自动解析：

fileA='aaaa.txt'
fileB='bbbb.txt'
n=100
string='hello'
R CMD BATCH --vanilla "--args $fileA $fileB $n $string" Rscript_file.R

• 补充提示：所有通过命令行传入R的参数默认均为字符类型，如果你需要使用数值型参数（比如示例中的n=100），需要手动完成类型转换：

n <- as.numeric(args[3])

内容的提问来源于stack exchange，提问作者pingu87