学校服务器在线RStudio安装vegan包报错cannot find -lgfortran求助

编译vegan源码包时需要链接gfortran运行库，当前服务器环境未安装对应的libgfortran开发包，或gfortran库路径未加入系统链接搜索路径，导致链接阶段失败，对应错误标识为：
/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran

根据你是否拥有服务器sudo权限，选择对应方案：

有sudo权限 #

根据服务器发行版执行对应命令安装系统依赖：

• Debian/Ubuntu系列

sudo apt update
# R4.0.3对应系统版本可直接执行：
sudo apt install -y gfortran libgfortran5

• RHEL/CentOS/Anolis系列

sudo yum install -y gcc-gfortran libgfortran

依赖安装完成后回到RStudio，重新执行install.packages("vegan")即可。

无sudo权限（学校服务器普通用户常见场景） #

可选择两种绕过方案：

方案1：安装预编译二进制包 #

无需自行编译，直接安装已经编译好的vegan包：

• R内直接安装二进制包：

install.packages("vegan", type = "binary")

• 若上述命令失败，可使用conda安装：
  先在SSH终端执行conda安装命令：

conda install -c conda-forge r-vegan

安装完成后打开R即可直接加载vegan包。

方案2：指定库路径手动编译 #

如果服务器上已经安装了gfortran，只是库路径未被系统识别，先在SSH终端搜索libgfortran路径：

find /usr /opt /home  -name "libgfortran.so*" 2>/dev/null

假设搜索得到路径为/opt/gcc10/lib64/libgfortran.so，则在R内先设置链接路径再安装：

Sys.setenv(LDFLAGS = "-L/opt/gcc10/lib64")
install.packages("vegan")

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Joy Zheng