你的问题核心在于Biostrings不是CRAN上的包，而是Bioconductor的专属包，devtools默认只会从CRAN查找依赖，所以直接安装paprbag时会找不到它。加上你的R版本（3.5.3）对应Bioconductor的旧版本（3.8），需要用特定方式安装兼容的Biostrings，具体步骤如下：

1. 先安装对应版本的Bioconductor包管理工具
   R 3.5.x对应的Bioconductor版本是3.8，所以需要安装兼容这个版本的BiocManager：

   install.packages("BiocManager", version = "3.8")
   

2. 通过BiocManager安装Biostrings
   用BiocManager指定Bioconductor版本来安装匹配的Biostrings：

   BiocManager::install("Biostrings", version = "3.8")
   

   如果这一步报错，也可以试试旧版的Bioconductor安装脚本（已弃用但对旧R版本仍有效）：

   source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
   biocLite("Biostrings")
   

3. 再次尝试安装paprbag
   当Biostrings安装成功后，再运行你的安装命令：

   devtools::install_github("crarlus/paprbag")
   

额外提示：R 3.5.3已经是比较老旧的版本了，很多新包和依赖都不再支持它。如果后续还会遇到类似包兼容问题，建议升级到R 4.x版本，这样能直接使用最新的Bioconductor资源，避免版本匹配的麻烦。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user249018