Slurm提交作业时sbatch的--output与--error参数不生效问题

问题根因 #

你遇到的参数不生效问题是sbatch命令的参数位置错误导致的：所有sbatch的控制参数必须放在作业脚本路径之前，放在脚本路径之后的内容会被Slurm识别为传递给作业脚本本身的位置参数，不会被当成sbatch的调度参数处理，因此你设置的输出路径规则完全没有生效。

修复方案 #

调整命令中参数的顺序即可，修改后的提交命令如下：

sudo su -c 'sbatch --error=/home/slurm/job%j.out --output=/home/slurm/job%j.out /home/slurm/job.script' slurm

可选优化 #

你也可以直接把输出路径规则写到作业脚本的#SBATCH头配置中，提交作业时无需额外加参数，修改后的作业脚本如下：

#!/bin/sh
#SBATCH --time=1
#SBATCH --output=/home/slurm/job%j.out
#SBATCH --error=/home/slurm/job%j.out
srun -l /bin/hostname
srun -l /bin/pwd
srun -l echo "hello world"

额外注意事项 #

请确保你指定的输出目录/home/slurm/对slurm用户开放读写权限，否则即使参数正确也会出现权限报错，可以执行以下命令设置目录权限：

sudo chown -R slurm:slurm /home/slurm/

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Akira