ImageJ 宏循环无法切换到下一个ROI 仅重复使用首个ROI处理

问题根因 #

你当前宏的核心问题是循环内没有在选中下一个ROI前重新激活原图窗口：当第一轮循环执行run("Internal Clipboard")后，新生成的裁剪图会成为系统当前激活窗口，后续循环的roiManager("select",i)没有作用在你要处理的原图「AA」上，导致始终调用第一个ROI的参数执行复制。

修复方案 #

在循环内部第一行新增selectWindow("AA")，保证每次选择ROI都作用在原图上，同时可优化重命名逻辑避免纯数字命名冲突，修复后代码如下：

runMacro("OpenROI");
rename("AA");
selectWindow("AA");
n=roiManager("count");

for(i=0;i<n;i++){
    selectWindow("AA");
    roiManager("select",i);
    run("Copy");
    run("Internal Clipboard");
    rename("crop_" + i);
}

selectWindow("AA");
run("Close");
run("Images to Stack", "name=Stack title=[] use");
run("Z Project...", "projection=[Average Intensity]");

如果不需要修改命名规则，保留原有rename(i)逻辑也可正常运行。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Jonathan Pacheco