使用Pandas转置数据并将原第一列设置为表头的问题求解

你出现多余表头的原因是：读入原始数据时设置header=None，DataFrame会默认生成从0开始的整数行索引，转置后这部分索引会成为新的列名，因此出现了1、2、3、4的多余行。

可行代码 #

import pandas as pd
# 读入原始tab分隔的无表头数据
df2 = pd.read_csv('3.dat', sep='\t', header=None)
# 将存储Sample名称的第0列设为行索引后再转置，Sample名称会自动成为新的列名
df2_transposed = df2.set_index(0).T
# 输出时关闭行索引写入，即可得到符合要求的结果
df2_transposed.to_csv('3_0T.dat', sep='\t', index=False)

逻辑说明 #

• 原始数据有2列，第0列存Sample标识，第1列存对应数值
• set_index(0)把Sample标识转为行索引，转置后行索引会自动映射为新DataFrame的列名，直接实现Sample作为表头的需求
• 输出时设置index=False，避免默认的整数行索引被写入到结果文件中

内容的提问来源于stack exchange，提问作者UglyBetty