Linux下按列数删除行：如何移除.fam文件中列数不足6的行

方法1：awk命令（推荐，大文件秒处理） #

Linux、Unix、macOS系统直接在终端执行以下命令即可：
awk 'NF>=6' file.fam > filtered_file.fam

• 命令说明：awk内置变量NF代表当前行按空白符分割的字段数，该命令仅保留字段数≥6的行，处理结果输出到新文件filtered_file.fam，不会修改原文件，安全性高。
• 结果验证：执行wc -l file.fam filtered_file.fam即可对比原文件和处理后文件的行数，确认异常行已删除。

方法2：Python代码实现（适合需要集成到自有脚本的场景） #

逐行读取处理，内存占用极低，适合任意大小的文件：

with open("file.fam", "r", encoding="utf-8") as f_in, open("filtered_file.fam", "w", encoding="utf-8") as f_out:
    for line in f_in:
        # 按空白符分割行，跳过首尾空白后统计字段数
        if len(line.strip().split()) >= 6:
            f_out.write(line)

以上两种方法都完全适配PLINK fam文件的空白分隔格式，不会误判行尾空格为额外字段，示例中仅含5个字段的6 6 0 0 1 行会被正确过滤，其余正常行全部保留。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Aryh