从制表符分隔txt文件提取指定范围整数、小数及科学计数法数值

需求说明 #

• 输入文件为4行4列的制表符分隔txt，第一行为表头，第一列为行名
• 需要提取第2到4行、第2到4列的所有数值（支持整数、小数、科学计数法格式）
• 输出要求为空格分隔的连续数值串，末尾追加换行符\n

示例输入文件内容 #

component   sigma          h2           h2_se
G           -5.55758e-19   -0.0964725   26.3887
GxE         6.13144e-18    1.09647      26.3651
noise       0              0            0

期望输出 #

-5.55758e-19 -0.0964725 26.3887 6.13144e-18 1.09647 26.3651 0 0 0

错误尝试说明 #

此前的grep命令没有覆盖数值的负号、科学计数法标识、整数等多种格式，无法得到完整正确的结果：

• grep -o '0.[[:digit:]]*' myfile：仅能匹配0开头的小数，漏配负数、非0开头数值、科学计数法数值
• grep -o '[[:digit:]]*' myfile：仅能匹配数字片段，漏配负号、小数点、科学计数法标识，拆分后输出零散的数字内容

可行解决方案 #

使用awk按行号过滤、按字段提取即可精准实现需求，命令如下：

awk 'NR>1 {printf "%s %s %s ", $2,$3,$4}END{printf "\n"}' myfile

命令逻辑说明 #

• NR>1：过滤掉第1行表头，仅处理第2到4行的有效数据
• printf "%s %s %s ", $2,$3,$4：对每一行按顺序输出第2、3、4列的内容，列之间用空格分隔
• END{printf "\n"}：所有行处理完成后在末尾追加换行符

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Yang