如何修改ggplot2点图的Y轴顺序使其按X轴数值从小到大排序

要实现Y轴按X轴数值大小排序，核心是调整Y轴离散变量GOs的因子水平顺序，ggplot2默认会按照因子的levels属性排列离散轴条目，你可以用reorder()函数快速实现排序，无需修改原始数据结构。

修改后的绘图代码 #

你只需要调整aes中y的映射即可，其余代码保持不变：

ggplot(data = data, aes(x = GeneRatio, y = reorder(GOs, GeneRatio), 
                        color = `p.adjust`, size = Count)) + 
  geom_point() +
  scale_color_gradient(low = "red", high = "blue") +
  theme_bw() + 
  ylab("") + 
  xlab("") + 
  ggtitle("GO enrichment analysis")

补充说明 #

• reorder(GOs, GeneRatio)会将GOs转为因子类型，默认按每个GO对应的所有GeneRatio的平均值从小到大设置因子水平，Y轴会按因子水平从下到上依次排列
• 如果你想要X轴数值越大的GO在Y轴越靠下，只需要改为reorder(GOs, -GeneRatio)即可
• 如果你需要按某个特定分组（比如仅按Condition为A的GeneRatio）排序，可以提前处理数据的因子水平：

  library(dplyr)
  data <- data %>%
    mutate(GOs = factor(GOs, levels = unique(GOs[order(GeneRatio[Condition == "A"])])))
  

  处理完成后直接用原始的y = GOs映射绘图即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者joffie