R语言按ID分组计算分位数分组失效仅返回全局结果问题求助

核心原因是dplyr和plyr两个包的summarize()函数产生了命名冲突：如果你的R环境中先加载了dplyr、后加载了plyr，plyr包的同名函数会覆盖dplyr的summarize()，而plyr版本的summarize()无法识别dplyr生成的分组结构，只会返回全局汇总的结果，也就是你看到的仅一行的统计值。
从你提供的str(ex_long)输出可以看到，ex_long已经成功按照ID分为86个组，排除数据本身分组错误的可能。

• 显式指定调用dplyr的summarize函数，修改代码如下：

tab <- ex_long %>% 
  group_by(ID) %>% 
  dplyr::summarize(
    q25 = quantile(val, probs = qnt[1]), 
    q75 = quantile(val, probs = qnt[2]),
    Mediana = quantile(val, probs = qnt[3]), 
    q2.5 = quantile(val, probs = qnt[4]), 
    q97.5 = quantile(val, probs = qnt[5])
  )

• 若不需要使用plyr包功能，可先卸载plyr包后再运行原代码：

detach("package:plyr", unload = TRUE)

• 重启R会话，加载包时保证dplyr在plyr之后加载，也可直接加载tidyverse套件规避冲突。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者noob_researcher