运行scipy dendrogram时Spyder内核偶发异常崩溃问题求助

问题表现 #

运行层次聚类树状图相关代码时，内核并非每次运行都会崩溃：例如使用自定义数组D运行时会触发崩溃，但使用D+1运行时无异常。

可复现问题的测试代码 #

import numpy as np
import scipy.cluster.hierarchy as sch
from scipy.spatial.distance import squareform
n = 5674
np.random.seed(0)
D = np.random.randint(35,size=(n,n))
for i in range(n):
    D[i,i] = 0
for i in range(n-1):
    for j in range(i+1,n):
        D[j,i] = D[i,j]
condensedD = squareform(D)
Y1= sch.linkage(condensedD)
Z1 = sch.dendrogram(Y1)

运行环境与报错信息 #

当前使用的是2021年11月6日执行conda update --all升级到最新版本的Anaconda环境，触发崩溃时输出如下错误，同时内核冻结且不会自动重启：

File "C:\Anaconda3\lib\site-packages\spyder\plugins\ipythonconsole\utils\manager.py", line 92, in _kill_kernel
    self.kill_proc_tree(self.kernel.pid)
AttributeError: 'SpyderKernelManager' object has no attribute 'kernel'

已尝试的无效解决方案 #

现有公开反馈显示该问题可能与matplotlib组件相关，freetype=2.10.4降级方案对部分用户有效，但未解决当前环境下的问题，已测试的无效操作如下：

• 执行conda install jupyter_client=6.1.12 freetype=2.10.4：AttributeError不再出现，但内核会一直显示「Restarting kernel...」，无其他报错输出
• 降级ipykernel到6.2.0版本：问题未解决
• 从Powershell启动Spyder：问题未解决

恳请各位提供可行的解决方案，万分感谢。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者ichthyophile